方以智这样的制度有三个好处。首先，所谓以文驭武最大的坏处，就是上下隔绝，外行指导内行，而现在无论是枢密院还是都督府，都是军官充任，平时建设训练归枢密院、战时指挥归都督府，而且枢密院也就起个统筹作用，具体任务还是要下达。其次，如果身边有军校或者军官朋友的人应该都知道，近现代的军官提拔，和古代最大区别就在于参谋制度的引进。一个军校生，毕业后，先是分配到基层连排干上一两年，然后如果上面要提拔你，并不会让你直接升连长之类，而是先把你调到团部里当参谋，锻炼一段时间再分配下去。因为如果长期在指挥职务上任职，一把手当惯了，很容易养出军头习气，并且专于具体事务，却缺乏大局观，缺少更高的视野和全局部署规划的能力。而参谋干久了，也很容易造成纸上谈兵、华而不实的情况，一个优秀的新式军官，必须两者兼备，故而采取这种“轮换培养”的模式。其三，就是分权了，指挥官虽然在战场上说一不二，但军官调动、日常训练、装备物资却要听从枢密院计划，而军队的总体建设，又绕不开兵部。三个部门互相牵制，但又互相交融，一方面职权独立，另一方面人员又流通，一个将领可以今年在都督府下面当总兵，明年又被调到枢密院做承旨，退役后又转任兵部侍郎，管些征兵、审计的文书工作。站在百官之首的瞿式耜见身后喧嚷逐渐平息，心中不免感叹，陛下果真是天纵英才啊。至于皇位之上的朱由榔，面色不免还是有点红的，心中默念“沙恩霍斯特将军、毛奇元帅，这可怪不得我啊，我也是被逼无奈啊。”一百多年后，由普鲁士天才般的军事家们所建立的近代总参谋部体制，就这样被无耻的剽窃了。当然，朱由榔所建立的这个“总参”是相当简陋的，其他不说，除了一个总参谋部，下面各军、各师的参谋机关呢？影子都还没有，就算有，朱由榔能找得出这么多有文化水平的军事人才来吗？所以他不过只是垫上了高楼大厦的上的建树，更是非凡，在明末之世，于学术一道，可谓冠绝同龄，并且所学甚杂，除了在文章上倡导散文，反对八股，而且家学渊源、博采众长，涉猎文、史、哲、地理、医药、物理。因为他的故乡，叫做桐城，而其人正是——方以智。 科学先驱（上）“牧公日理万机，学生实在是叨扰了。”方以智虽然名头再大，但对方毕竟是内阁辅臣，当朝宰执，他也不敢倨傲，只是执晚辈礼拜访。堵胤锡出身寒微，而且也不是那种天之骄子的科场俊杰，比方以智大了十几岁的他也就比对方早一届进士而已，名次也不高，若是换做太平时节，大概最后就是在地方上当个参政之类限制致仕，但时势造英雄，板荡之下，原本只能在府县基层打转的他，却走到了那些个名士大儒望尘莫及的位置。
“密之不必多礼，我知道你是想来问些什么的。”“这次陛下召你为翰林学士，应是好事，之前肇庆之时，国家危难，也一直没有什么翰林院之说。密之家学渊源，才名彪炳，陛下大概也是存了千金买马骨的意思。你在崇祯之时不就是翰林侍读学士嘛，如今官复原职，还有所提携，有什么好惶恐的。”不同于之前聚集在肇庆拥立朱由榔的这帮两广官僚，方以智那是正儿八经的进士及，才算是正儿八经的制诏，否则，只能算中旨。事实上，对于制约皇权这件事情，朱元璋在废除宰相之后，却依旧保留了六科封驳之权，从制度上，如果从内阁到六科的官员誓死不从，皇帝的诏书就没有意义。但中期以后，天子们开始利用太监钳制文官，而后直接绕过内阁、六科，下达中旨，所谓“封驳审议”，形同虚设。于是乎，文官既然在制度上无法限制皇帝，那就干脆摆烂，通过扯皮和对喷来拖延挣扎，皇帝也只能靠不断加强宦官权柄，监督执行。朱由榔既然立下了规矩，就得自行遵守，纵使他如果真的绕开内阁，直接下旨，一样无人敢质疑，但规矩就是规矩，自己都带头践踏，就无法用以约束他人，所以朱由榔凡有意旨，都要征询内阁决议，当然，内阁不敢不同意罢了。方以智抵达南京后，从其他旧友关系中得知，如今天子重建后的翰林院，似乎与原本翰林大不相同，故而上任之前，再加之这些天，皇帝的种种操作，心中揣揣，却是先来拜访堵胤锡。“牧公，可我听说，陛下却是废了翰林当中许多机构，而是设立了些什么……物理所，可有此事啊？”前日他和一名老友聚会，那人酒桌之上就抱怨过。说陛下为奸人所蛊惑，好好地翰林院文华之地，不去专心修订校对典章制度，而是要搞个什么物理研究所、化学研究所，实在有辱斯文，甚至有原本被征用的士子，知道情况后主动辞职挂印而去。这让方以智大为疑惑堵胤锡笑着捋了捋长须，让自家儿子给二人斟茶，缓缓问道“我听说密之你以前和崇祯时钦天监的汤若望走得比较近？”“确有此事，汤先生格物学问了得，学生和他多有交际。”堵胤锡颔首“这边是缘故所在了，之前陛下点名要你来做这个翰林学士，我还觉得奇怪，后来打听了一下，我估计就是这个缘由，密之你对格物之学也有所钻研吧？”这倒是朱由榔自己对历史记得不清楚，这时候的方以智，由于受战乱影响，还没写完《物理小识》，他在科学上的成就总结，主要集中于晚年。其实所谓“
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